拉卡拉POS機刷卡手續費并非由單一機構收取，而是由發卡行、清算機構和收單機構三方共同分配。

具體來說，手續費的主要部分流向發卡行，即持卡人所屬的銀行。發卡行在交易中承擔了資金墊付和風險管理的責任，因此收取一定比例的服務費，這部分費用通常占手續費的70%左右。例如，在一筆10000元的信用卡交易中，發卡行可能會收取約42元的手續費。

清算機構（如中國銀聯）也會從手續費中分得一部分。清算機構負責交易信息的傳遞和資金的清算，確保交易能夠順利完成。清算機構收取的網絡服務費通常占手續費的10%左右，用于維護支付系統的穩定運行，確保交易的安全性和高效性。在上述例子中，清算機構可能會收取約6元的手續費。

收單機構（如拉卡拉）作為POS機服務的提供方，同樣會從手續費中獲得一定比例的收入。收單機構負責為商戶提供POS機設備、技術支持以及資金結算服務，因此收取的服務費通常占手續費的20%左右。這部分費用用于覆蓋設備成本、運營成本以及提供客戶服務的費用。在上述例子中，收單機構可能會收取約12元的手續費。

需要注意的是，手續費的具體分配比例并非固定不變，而是根據交易類型、行業屬性以及商戶與支付機構的協議有所不同。例如，信用卡交易的手續費通常高于借記卡交易，因為信用卡交易涉及更高的風險成本。